1. 人才招聘与留用：科创企业通常需要高素质、高技术水平的人才，但这样的人才市场竞争激烈，用何种方式吸引和保留优秀员工是一大难点。

2. 绩效管理：科创企业往往注重创新和高速发展，对员工的绩效要求也较高，如何设置有效的绩效评估体系，激励并保持员工的高绩效成为一大难点。

3. 薪酬管理：科创企业通常面临融资有限、盈利周期长的情况，有限的薪酬预算如何合理分配，既能吸引人才又能控制成本，是一项具有挑战性的任务。

4. 团队建设与文化塑造：科创企业需要高度团队协作和创新能力，但由于企业快速发展和高压环境，不注重与员工的情感沟通与交流，忽视企业文化的建设及价值观的树立，如何打造积极向上的企业文化，提高团队的凝聚力和归属感，需要克服许多困难。

5. 法律合规与风险防控：科创企业需要遵循复杂的劳动法规和知识产权法律，合规管理是必须的，但由于科技进步的快速变化和法律的瞬息万变，如何确保企业的法律合规性和风险防控，也是一个重要的难点。